En mögelsanering kan göras i både krypgrund och vind. Sanering är ofta nödvändig när skador i utrymmet gått så långt att det är synligt mögel eller lukt.
Behov av en mögelsanering uppkommer ofta efter för mycket fukt genom fuktskada eller inträngande fukt från uteluft.

Krypgrund med städbehov
De två vanligaste saneringsmetoden är ozon och kemi. En ozonsanering sker genom att man placerar en elektronisk utrustning som genererar ozon. Ozonet bryter ner lukt och dödar ytligt mögel.

Sanering av skadad vind
Vid en kemisk mögelsanering använder man ofta någon form av klor eller annan mögeldödande kemi. Det penslas eller foggas ut i utrymmet. Med rätt utförd behandling med klor kommer trämaterial i utrymmet att se ut som nytt. De flesta klortyperna som används för sanering är extremt giftiga under hanteringen vilket gör dom olämpliga för lekmän att hantera. Det krävs kunskap och omfattande skyddsutrustning för att hantera denna typ av kemi. Fördelen med klor är att i princip är helt ofarligt 30 minuter efter behandling och inte lämnar kvar något mögel på ytan.